生物安全柜是為操作原代培養物、菌毒株以及診斷性標本等具有感染性的實驗材料時，用來保護操作者本人、實驗室環境以及實驗材料，使其避免暴露于上述操作過程中可能產生的感染性氣溶膠和濺出物而設計的。
使用方法：
1、操作前應將本次操作所需的全部物品移入安全柜，避免雙臂頻繁穿過氣幕破壞氣流；并且在移入前用75%酒精擦拭表面消毒，以去除污染。
2、打開風機5～10分鐘，待柜內空氣凈化并氣流穩定后再進行實驗操作。將雙臂緩緩伸入安全柜內，至少靜止1分鐘，使柜內氣流穩定后再進行操作。
3、安全柜內不放與本次實驗無關的物品。柜內物品擺放應做到清潔區、半污染區與污染區基本分開，操作過程中物品取用方便，且三區之間無交叉。物品應盡量靠后放置，但不得擋住氣道口，以免干擾氣流正常流動。
4、操作時應按照從清潔區到污染區進行，以避免交叉污染。為防可能濺出的液滴，可在臺面上鋪一用消毒劑浸泡過的毛巾或紗布，但不能覆蓋住安全柜格柵。
5、柜內操作期間，嚴禁使用酒精燈等明火，以避免產生的熱量產生氣流，干擾柜內氣流穩定；且明火可能損壞HEPA濾器。
6、工作時盡量減少背后人員走動以及快速開關房門，以防止安全柜內氣流不穩定。
7、在實驗操作時，不可打開玻璃視窗，應保證操作者臉部在工作窗口之上。在柜內操作時動作應輕柔、舒緩，防止影響柜內氣流。
8、安全柜應定期進行檢測與保養，以保證其正常工作。工作中一旦發現安全柜工作異常，應立即停止工作，采取相應處理措施，并通知相關人員。
9、工作完成后，關閉玻璃窗，保持風機繼續運轉10～15分鐘，同時打開紫外燈，照射30分鐘。（在紫外滅菌時要關閉通風;紫外光對人體有損害，注意個人保護。）
10、安全柜應定期進行清潔消毒，柜內臺面污染物可在工作完成且紫外燈消毒后用2%的84消毒液擦拭。柜體外表面則應每天用1%的84消毒液擦拭。
11、柜內使用的物品應在消毒后再取出，以防止將病原微生物帶出而污染環境。
生物安全柜的注意事項：
l 緩慢移動原則：為了避免影響正常的風路狀態，柜內操作時手應該盡量平緩移動。
l 物品平行擺放原則：為了避免物品和物品之間的交叉污染現象產生，在柜內擺放的物品應該盡量呈橫向一字擺開，避免回風過程中造成交叉污染。同時避免堵塞背部回風隔柵影響正常風路。
l 避免震動原則：柜內盡量避免震動儀器（例如離心機、旋渦振蕩器等）的使用，因為震動會使得積留在濾膜上的顆粒物質抖落，導致操作室內部潔凈度降低，同時如果在前操作面平衡失敗還會引起安全柜對操作者的污染。
l 不同樣品柜內移動原則：柜內兩種及以上物品需要移動時，一定遵循低污染性物品向高污染性物品移動原則，避免污染性高的物品在移動過程中產生對柜體內部的大面積污染。
l 明火使用原則：柜內盡量不要使用明火。因為在明火使用過程中產生的細小顆粒雜質將被帶入濾膜區域，這些高溫雜質會損傷濾膜。無法避免一定需要使用的時候，宜使用低火苗的本生燈。
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